Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie Avenzoar Digital Pathology Tool, działająca w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać pod adresem avenzoar_12_27_2008.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie Avenzoar Digital Pathology Tool, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Narzędzie Avenzoar Digital Pathology Tool do uruchomienia w systemie Linux online
OPIS
Avenzoar to trwające rok badania nad morfologią raka nerkowokomórkowego i powiązanymi z nim polimorfizmami pojedynczego nukleotydu (SNPa) jako metodą automatyzacji diagnozowania raka za pomocą wspomaganego komputerowo drzewa decyzyjnego kontrolowanego przez statystyki analityczne.Zakładka Charakterystyka
- Wykrywa i przeprowadza diagnostykę wspomaganą komputerowo (CAD) jednego z 4 typów raka nerkowokomórkowego (RCC / raka nerki)
- Umożliwia katalogowanie przypadków z pomocniczymi danymi SNP i wcześniej analizowanymi obszarami zainteresowania
- Współpracuje z biblioteką libOpenSlide, dzięki czemu obsługuje szeroką gamę cyfrowych obrazów slajdów patologicznych od wielu różnych dostawców (Hammamatsu, Aperio, Bacus, Omnyx)
- Dostarcza metryki LOH (utrata heterozygotyczności) poprzez odczyt danych SNPa przekonwertowanych z tablic Affymetrix do plików CSV
- Eksportuje obrazy do wykorzystania w prezentacjach dla innych klinicystów, pacjentów lub badaczy
- Podkreśla obszary zainteresowania na obrazach morfologicznych
- Zapewnia otwarte ramy do oznaczania obrazów naukowych dowolnego typu
- Ładuje JPEG, BMP, PNG i inne formaty obsługiwane przez SDL_Image
- Ma ładny GUI dostarczony przez libAgar
- Przetestowano pod kątem działania na SuSE, Ubuntu, Win32/64
- Wersja Java zbudowana za pomocą Processing (Przetwarzanie.org)
- Natywna wersja C
- Dostępna jest licencja komercyjna. Prosimy o kontakt.
- Skorelowane wyniki wyszukiwania według morfologii lub kompleksowego testu (działa dobrze!)
- Można go używać na serwerze internetowym jako narzędzia wiersza poleceń, które generuje gotowy do użycia w Internecie kod HTML i obrazy wynikowe do prezentacji w Internecie
Publiczność
Organizacje non-profit, branża opieki zdrowotnej, nauka/badania, zaawansowani użytkownicy końcowi, programiści
Interfejs użytkownika
Internetowe, SDL
Język programowania
C, Jawa
Środowisko bazy danych
Plik płaski
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/avenzoar/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
