To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie GNomEx, której najnowszą wersję można pobrać jako gnomex_tomcat_5.35.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie GNomEx z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
GNomEx
OPIS
Nasz kod źródłowy jest teraz na GitHub: https://github.com/hci-gnomex/gnomex. Najnowszy kod można znaleźć w serwisie GitHub.
GNomEx to genomowe LIMS i repozytorium danych. Przechowuje eksperymenty z adnotacjami i dalsze analizy oraz udostępnia ścieżki danych do popularnych przeglądarek genomu, takich jak przeglądarka genomu IGB, IGV i UCSC. LIMS obsługuje wszystkie aspekty eksperymentu, od zamówienia po dostarczenie wyników. Obsługiwane platformy eksperymentalne obejmują Illumina HiSeq, MiSeq, iScan, sekwencjonowanie ABI Sanger, mikromacierze Affy i Agilent, Sequenom MassArray i Bioanalyzer.
GNomEx to aplikacja internetowa z interfejsem użytkownika klienta Flash i zapleczem Java, która działa na Apache Tomcat. Do bazy danych używany jest MySQL, chociaż można użyć dowolnego nowoczesnego systemu RDBMS.
Zakładka Charakterystyka
- Możliwość konfiguracji dla wielu różnych platform sekwencjonowania i eksperymentów
- Obsługa wielu podstawowych obiektów
- Automatyczne powiadomienia o rozliczeniach/klientach
- Konfigurowalne adnotacje dotyczące eksperymentów, próbek lub analiz
- Wbudowana przeglądarka plików ABI
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Oparte na sieci Web
Język programowania
Jawa, Flex
Środowisko bazy danych
MySQL
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/gnomex/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.