Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie High-Throughput Tabular Data Processor, działająca w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako HTDP.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie High-Throughput Tabular Data Processor, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Wysokowydajny procesor danych tabelarycznych do pracy w systemie Linux online
OPIS
HIGH-THROUGHPUT TABULAR DATA PROCESSOR (HTDP) to aplikacja Java, która ma ułatwić zadania eksploracji i redukcji danych w dużych plikach tekstowych wynikające z technologii o dużej przepustowości, np. masowo równoległego sekwencjonowania lub mikromacierzy. Oprogramowanie zostało zoptymalizowane pod kątem danych z mikromacierzy i głębokiego sekwencjonowania równoległego, jednak może akceptować dowolne zestawy danych tabelarycznych rozdzielanych znakami. HTTP może również importować, przetwarzać i konwertować pliki Variant Call Format (VCF) ver. 4.0, 4.1 i 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).HTTP zapewnia funkcję szybkiego filtrowania i może przetwarzać dane składające się z jednego lub wielu plików wejściowych.
Cytowanie: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) Wysokoprzepustowy procesor danych tabelarycznych - niezależne od platformy narzędzie graficzne do przetwarzania dużych zbiorów danych. PLoS JEDEN 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Zakładka Charakterystyka
- działa na dowolnych kolumnach danych rozdzielanych znakami (np. BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- łączyć pliki danych tabelarycznych w pionie iw poziomie
- scal dowolne pliki danych tabelarycznych przy użyciu lokalizacji genomu lub wspólnych kolumn
- nieograniczone możliwości filtrowania i redukcji danych
- różne pliki pod względem formatu i zawartości mogą być analizowane w tym samym czasie
Język programowania
Java
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/htdp/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
