To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie lr2rmats, której najnowszą wersję można pobrać jako lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie lr2rmats z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
lr2rmaty
OPIS
lr2rmats to lekki potok oparty na Snakemake, który został zaprojektowany tak, aby wykorzystywać dane RNA-seq zarówno trzeciej generacji do długiego odczytu, jak i krótkiego odczytu drugiej generacji do generowania ulepszonego pliku adnotacji genów. Nowo wygenerowany plik z adnotacjami może zostać dostarczony do rMATS w celu analizy alternatywnego splicingu różnicowego.
Więcej informacji można znaleźć pod adresem https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
Zakładka Charakterystyka
- Długie czytanie
- sekwencja RNA
- Splicing alternatywny
- Nauki biologiczne Pacyfiku
- Technologie Oxford Nanopore
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
Powłoka uniksowa, Python, C
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
