Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie Meraculous-2D do uruchomienia w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako Meraculous-v2.2.6.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie Meraculous-2D, aby bezpłatnie uruchomić Linuksa online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Meraculous-2D do uruchomienia w Linuksie online
OPIS
----------------------------------------WAŻNE: Meraculous-2D został zastąpiony przez asembler HipMer. Pobierz stąd: https://sourceforge.net/projects/hipmer/
-----------------------------------------
Meraculous-2D to asembler całego genomu do odczytów NGS (Illumina), który jest zdolny do składania dużych, diploidalnych genomów przy skromnych wymaganiach obliczeniowych. Dodatki zawarte:
- Wydajne zliczanie k-merów i przechodzenie przez wykres deBruijna
- Dwa tryby postępowania z diploidalną zmiennością alleli
- Udoskonalone rusztowanie, które zapewnia bardziej kompletne zespoły bez pogorszenia dokładności rusztowania.
Zespół jest napędzany przez potok perl, który wykonuje fragmentację danych i równoważenie obciążenia, a także przesyłanie i monitorowanie wielu tablic zadań w klastrze typu GE/SLURM lub samodzielnym serwerze wielordzeniowym.
Zgłaszane rękopisy:
https://arxiv.org/abs/1703.09852
https://arxiv.org/abs/1608
Zakładka Charakterystyka
- Zespół genomu eukariotycznego
- Specjalistyczne tryby genomu o wysokiej i niskiej heterozygotyczności
- Wbudowane wykonanie rozproszone
- Wydajne operacje kosmiczne k-mer
- Wdrożenie gotowe na pojedynczy serwer i klaster (przygotowanie do AWS)
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
Perla, C++
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/meraculous20/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
