Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie Open Drug Discovery Toolkit (ODDT), której najnowszą wersję można pobrać jako ODDT0.7.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Zestaw narzędzi Open Drug Discovery (ODDT)
OPIS
Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) to modułowy i wszechstronny zestaw narzędzi do użytku w cheminformatyce, modelowaniu molekularnym itp. ODDT jest napisany w Pythonie i szeroko wykorzystuje Numpy/Scipy. Możesz użyć dowolnego obsługiwanego zestawu narzędzi zjednoczonego w ramach wspólnego API (dla odniesienia patrz Pybel lub Cinfony). Wszystkie metody i oprogramowanie oparte na Pybel/Cinfony powinny być kompatybilne z zestawami narzędzi ODDT. W przeciwieństwie do swoich poprzedników, które miały mieć minimalistyczne API, ODDT wprowadza rozszerzone metody i dodatkowe uchwyty. Rozszerzenia te pozwalają na pełne wykorzystanie zestawów narzędzi, a niektóre funkcje mogą zostać przeniesione z innych w celu wprowadzenia brakujących funkcji. Najważniejszą i poręczną właściwością Molecule w ODDT są słowniki Numpy zawierające większość właściwości dostarczonej cząsteczki. Niektóre z nich są proste, inne wymagają pewnej kalkulacji, np. cechy atomu. Dla głównych jednostek cząsteczek dostępne są słowniki.
Zakładka Charakterystyka
- Dla głównych podmiotów dostępne są słowniki
- Główną korzyścią jest cudowne nadawanie i podzbiór Numpy
- Każdy słownik jest zdefiniowany jako format w Numpy
- Interakcje między dwiema cząsteczkami są obliczane i przechowywane w odcisku palca
- Sprawdź interakcje między cząsteczkami
- Możesz użyć dowolnego obsługiwanego zestawu narzędzi zjednoczonego w ramach wspólnego interfejsu API
Język programowania
Python
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/oddt.mirror/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
