To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie SecStAnT do uruchamiania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako SecStAnT.jar. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie SecStAnT, aby działać w systemie Linux online z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
SecStAnT do uruchomienia w systemie Linux online
OPIS
SecStAnT to narzędzie do automatycznego tworzenia zestawów danych struktur z Protein Data Bank (PDB) ze zdefiniowanym przez użytkownika składem strukturalnym oraz do obliczania ich rozkładów zmiennych wewnętrznych.SecStAnT jest w stanie
1. Wybierz ze zbiorów danych PDB struktury oparte na określonych przez użytkownika strukturach drugorzędowych (zdefiniowanych na podstawie wewnętrznej klasyfikacji PDB lub DSSP) i/lub motywów sekwencji.
2. Zbuduj zestawy danych na różnych poziomach rozdzielczości (wszystkie atomy, tylko szkielet, tylko Cα, ...)
3. Oceń rozkłady statystyczne zmiennych wewnętrznych:
A. rozkłady pojedynczych zmiennych (w tym najbardziej istotne w reprezentacji atomistycznej, np. PHI i PSI oraz szereg tych dla reprezentacji opartej na Cα)
B. korelacje dwóch zmiennych (w tym mapa PHI-PSI Ramachandran i jej odpowiednik w reprezentacji opartej na Cα)
C. korelacje trzech zmiennych
Interfejs użytkownika
Huśtawka Java
Język programowania
Java
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/secstant/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
