To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie SUPERmerge, działająca w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać w formacie SUPERmerge.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie SUPERmerge, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
SUPERmerge do uruchomienia w systemie Linux online
OPIS
SUPERmerge to algorytm analizy pileup odczytu ChIP-seq i algorytm adnotacji do badania plików dopasowania (BAM) zbiorów danych ChIP-seq rozproszonych modyfikacji histonów z szerokimi domenami chromatyny na poziomie rozdzielczości pojedynczej pary zasad. SUPERmerge umożliwia elastyczną regulację różnych parametrów spiętrzenia odczytu, ujawniając w ten sposób, w jaki sposób wyspy odczytu agregują w obszary pokrycia w całym genomie i jakie cechy adnotacji odwzorowują w poszczególnych replikach biologicznych. SUPERmerge jest szczególnie przydatny do badania eksperymentów ChIP-seq o małej wielkości próbki, w których epigenetyczne modyfikacje histonów (np. H3K9me1, H3K27me3) skutkują naturalnie szerokimi pikami z rozproszonym zakresem wzbogacenia sygnału obejmującym wiele kolejnych loci genomowych i cech z adnotacjami.Zakładka Charakterystyka
- Sekwencja ChIP
- epigenetyka
- bioinformatyka
- biologia obliczeniowa
Publiczność
Nauka/Badania
Język programowania
C
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/supermerge/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
