Jest to aplikacja dla systemu Windows o nazwie DEBay, działająca w systemie Windows online za pośrednictwem systemu Linux online, której najnowszą wersję można pobrać w formacie Results.rar. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie DEBay, która będzie działać bezpłatnie w systemie Windows online w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZDJĘCIA EKRANU:
DEBay do uruchomienia w systemie Windows online za pośrednictwem systemu Linux online
OPIS:
DEBay: Dekonwolucja Ensemble poprzez podejście BayesaDEBay szacuje ekspresję genów specyficzną dla typu komórki poprzez dekonwolucję ilościowych danych PCR dla mieszanej populacji. Będzie to przydatne w eksperymentach, w których segregacja różnych typów komórek w próbce jest uciążliwa, ale można zmierzyć proporcje różnych typów komórek w próbce. DEBay wykorzystuje dane dotyczące rozkładu populacji i dane qPCR do obliczenia względnej ekspresji docelowego genu w różnych typach komórek w próbce.
Instrukcje instalacji i instrukcja obsługi DEBay: https://sourceforge.net/projects/debay/files/UserManual.pdf
Przykładowy zestaw danych testowych: https://sourceforge.net/projects/debay/files/Test_data/
Informacje o cytacie: Vimalathithan Devaraj i Biplab Bose. DEBay: narzędzie obliczeniowe do dekonwolucji ilościowych danych PCR w celu oszacowania ekspresji genów specyficznej dla typu komórki w populacji mieszanej. bioRxiv 2020 doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.10.035642
Zakładka Charakterystyka
- Dekonwoluuje ekspresję genów specyficzną dla typu komórki z ilościowych danych PCR
- Dekonwolutuje zarówno zależne od czasu, jak i niezależne dane dotyczące ekspresji genów
- Stosuje Bayesowską metodę estymacji parametrów
- Podaje statystyki oszacowanych parametrów
Publiczność
Nauka/badania, edukacja, inżynieria
Interfejs użytkownika
Projekt jest systemem interfejsu użytkownika (UI)
Język programowania
Python
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/debay/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.