Jest to aplikacja dla systemu Windows o nazwie Wizualizacja wykresów białek-ligandów, działająca w systemie Windows online w systemie Linux, której najnowszą wersję można pobrać jako plik vplg_2016_07_18.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie Wizualizacja wykresów białek-ligandów, która będzie działać bezpłatnie w systemie Windows online przez Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Wizualizacja wykresów białko-ligand do działania w systemie Windows online w systemie Linux online
OPIS
Pakiet oprogramowania Visualization of Protein-Ligand Graphs (VPLG) oblicza i wizualizuje wykresy białek. Działa na poziomie struktury superwtórnej i wykorzystuje współrzędne atomów z plików PDB oraz przypisania SSE algorytmu DSSP.VPLG to oprogramowanie wiersza poleceń. Jeśli nie lubisz wpisywać poleceń, wypróbuj nasz serwer WWW PTGL: http://ptgl.uni-frankfurt.de/
Zakładka Charakterystyka
- Odczytuje trójwymiarowe dane atomów z plików PDB i przypisań struktur drugorzędnych z plików DSSP
- Oblicza wykres białko-ligand na podstawie danych i wizualizuje wykres
- Obsługuje wyświetlanie obrazów wykresów w formatach bitmapowych (.png) i wektorowych (.svg).
- Eksportuje wykresy białko-ligand w postaci zwykłego pliku tekstowego we własnym formacie (.plg), który można łatwo edytować, analizować i generować za pomocą programu komputerowego, a także w wielu standardowych formatach plików wykresów
- Potrafi czytać i bezpośrednio wizualizować wykresy białek z plików .plg
- Darmowe oprogramowanie typu open source (FOSS)
- Obsługa baz danych (całkowicie opcjonalna, domyślnie nie jest wymagany serwer bazy danych)
- Interfejs wiersza poleceń umożliwia łatwe przetwarzanie wsadowe za pomocą skryptów powłoki
- Umożliwia filtrowanie ligandów według liczby atomów
- Nowy GUI napisany w Javie, nie musisz już wpisywać poleceń konsoli!
- Oprogramowanie obsługujące serwer WWW PTGL: http://ptgl.uni-frankfurt.de/
Publiczność
Nauka/badania, edukacja, zaawansowani użytkownicy końcowi
Interfejs użytkownika
Java Swing, konsola/terminal, wiersz poleceń
Język programowania
Java
Środowisko bazy danych
JDBC
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/vplg/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
