Este é o comando aevol_propagate que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
aevol - uma plataforma de evolução experimental in silico
SINOPSE
aevol_propagate -h or --Socorro
aevol_propagate -V or --versão
aevol_propagate [-v] [-g GERADOR] [-i INDIR] [-o EXTERIOR] [-S SEMENTE GERAL]
aevol_propagate [-v] [-g GERADOR] [-i INDIR] [-o EXTERIOR] [-s SELSEADO] [-m MUTSEED] [-t
SEMENTE DE ESTOCAGEM] [-e AMBIENTE] [-n SEMENTE DE NUVEM]
DESCRIÇÃO
Aevol é uma plataforma de simulação que permite deixar populações de organismos digitais
evoluir em diferentes condições e estudar experimentalmente os mecanismos responsáveis pela
estruturação do genoma e do transcriptoma.
aevol_propagate
cria uma nova cópia do experimento como era na geração dada. o
número de geração da cópia será redefinido para 0. Se você usar aevol_propagate
repetidamente para inicializar várias simulações, você deve especificar uma semente diferente
para cada simulação, caso contrário, todas as simulações produzirão exatamente os mesmos resultados.
Você pode usar a opção -S para fazer isso. Neste caso, os sorteios aleatórios serão
diferente para todos os processos aleatórios habilitados em suas simulações (mutações,
expressão gênica estocástica, seleção, migração, variação ambiental,
ruído ambiental). Alternativamente, para alterar os desenhos aleatórios para
processos aleatórios apenas, não use -S, mas as opções -m, -s, -t, -e, -n (ver
abaixo).
OPÇÕES
-h, --Socorro
imprimir a ajuda e depois sair
-V, --versão
imprimir o número da versão e sair
-dentro, --verbose
seja prolixo
-g, --gerador GERADOR
especifique o número de geração (padrão: aquele contido no arquivo last_gener.txt, se houver)
-eu, --no INDIR
especifique o diretório de entrada (padrão ".")
-ó, --Fora EXTERIOR
especificar o diretório de saída (padrão "./output")
-S, --semente geral SEMENTE GERAL
especifique um inteiro a ser usado como semente para números aleatórios. Se você usar
aevol_propagate repetidamente para inicializar várias simulações, você deve especificar um
sementes diferentes para cada simulação, caso contrário, todas as simulações produzirão
exatamente os mesmos resultados. Se você especificar esta semente geral, os desenhos aleatórios serão
diferente para todos os processos aleatórios habilitados em suas simulações (mutações,
expressão gênica estocástica, seleção, migração, variação ambiental,
ruído ambiental). Para alterar os desenhos aleatórios para um processo aleatório específico
apenas, não use -S, mas as opções abaixo.
-sim, --semente SELSEADO
especifique um inteiro como uma semente para números aleatórios necessários para seleção e migração
(se a estrutura espacial estiver habilitada).
-m, --mut-semente MUTSEED
especifique um inteiro como uma semente para números aleatórios necessários para mutações.
-t, --stoch-semente SEMENTE DE ESTOCAGEM
especifique um inteiro como uma semente para os números aleatórios necessários para o gene estocástico
expressão.
-e --env-var-semente AMBIENTE
especifique um inteiro como uma semente para números aleatórios necessários para variação ambiental.
-n, --env-noise-seed SEMENTE DE NUVEM
especifique um inteiro como uma semente para números aleatórios necessários para ruído ambiental.
Use aevol_propagate online usando serviços onworks.net
