Este é o comando exonpairs que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
exonpairs - exonpairs do módulo SNAP
SINOPSE
exonpares [opções]HMM lima>RÁPIDO lima> [opções]
OPÇÕES
-min-íntron
comprimento mínimo do íntron [30]
-max-íntron
comprimento máximo do íntron [10000]
-einit-comprimento
comprimento mínimo de Einit em bp [10]
-term-length
comprimento mínimo do Eterm em bp [10]
-exão de comprimento
comprimento mínimo do exon em bp [30]
-pontuação de íntrons pontuação íntron mínima em bits [-5]
-einit-pontuação
pontuação Einit mínima em bits [-5]
-term-score
pontuação mínima de Eterm em bits [-5]
-pontuação de exon
pontuação Exon mínima em bits [-5]
-par-pontuação
pontuação mínima do par (exon-intron-exon) [10]
- comprimento do flanco
comprimento da sequência de flanqueamento por exon [20]
-lcmask
tratar minúsculas como N
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