Este é o comando fastq-clipper que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
fastq-clipper - ea-utils: remove uma ou mais sequências de adaptador do arquivo fastq
DESCRIÇÃO
uso: fastq-clipper [opções]
Remove uma ou mais sequências de adaptadores do arquivo fastq. Sequências adaptadoras são
delimitado por dois pontos. As estatísticas vão para stderr, a menos que -o é especificado.
OPÇÕES
-h Esta ajuda
-o Arquivo de saída FIL (estatísticas para stdout)
-p N Porcentagem de diferença máxima (10)
-m N Comprimento mínimo do clipe (1)
-l N Comprimento mínimo de sequência restante (15)
-x [N] Comprimento de correspondência extra além do comprimento do adaptador,
N = -1: pesquisar todos N = 0: pesquisar apenas até o comprimento do adaptador
-e Fim da linha (padrão)
-b Começo da linha (ainda não suportado)
Use fastq-clipper online usando serviços onworks.net
