Este é o comando kmc_tools-kmers_subtract que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online Windows ou emulador online MAC OS
PROGRAMA:
NOME
kmc_tools-kmers_subtract - calcula a subtração de dois bancos de dados KMC
SINOPSE
kmc_tools kmers_subtract <output
[output_params]>
DESCRIÇÃO
O banco de dados de saída conterá apenas k-mers que estão presentes no primeiro conjunto de entrada, mas
ausente no segundo. O valor do contador é igual ao valor da primeira entrada
definido.
OPÇÕES
Para cada entrada, existem parâmetros adicionais:
-ci
excluir k-mers ocorrendo menos do que vezes
-cx
excluir k-mers ocorrendo mais de vezes
Para saída, existem parâmetros adicionais:
-ci
excluir k-mers ocorrendo menos do que vezes
-cx
excluir k-mers ocorrendo mais de vezes
-cs
valor máximo de um contador
EXEMPLO
kmc -k28 arquivo1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 arquivo2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools kmers_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_subtract -cs200
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