Este é o comando lastdb que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
lastdb - comparação em escala de genoma de sequências biológicas
SINOPSE
último banco de dados [opções] nome de saída arquivo (s) de sequência fasta
DESCRIÇÃO
Prepare as sequências para alinhamento subsequente com lastal.
OPÇÕES
a Principal Opções
-h, --Socorro
mostrar todas as opções e suas configurações padrão e sair
-p interpretar as sequências como proteínas
-R opções de marcação de repetição (padrão = 10)
-c letras minúsculas de máscara suave
Avançado Opções (padrão definições)
-Q formato de entrada: 0 = fasta, 1 = fastq-sanger, 2 = fastq-solexa, 3 = fastq-illumina (0)
-s tamanho do volume (ilimitado)
-m padrão de semente (não DNA: 1)
-u esquema de semeadura (DNA: YASS)
-w etapa de índice (1)
-a alfabeto definido pelo usuário
-i limite mínimo de correspondências iniciais por posição de consulta (0)
-b profundidade do balde
-C tipo de tabela filho: 0 = nenhum, 1 = tamanho do byte, 2 = tamanho curto, 3 = completo (0)
-x apenas conte as sequências e letras
-v seja prolixo: escreva mensagens sobre o que o lastdb está fazendo
-V, --versão
mostrar informações de versão e sair
RELATÓRIOS INSETOS
Relatar erros para: [email protegido]
ÚLTIMA página inicial: http://last.cbrc.jp/
Use lastdb online usando serviços onworks.net
