Este é o comando maf2anchors.pl que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online Windows ou emulador online MAC OS
PROGRAMA:
NOME
maf2anchors - Converte arquivos maf em conjuntos de âncora Murasaki
SINOPSE
maf2anchors
OPÇÕES
--prefix =
use como um prefixo para nomes de arquivo de saída (caso contrário, usa )
--rifts =
permitir até fendas.
--fakeseqs
gerar arquivos de comprimento de sequência falsos e stubs de sequência com base em dados de comprimento de sequência
no arquivo MAF
--Confiar em
confiar na anotação de comentário adicionada pelo TBA na segunda linha do arquivo (se houver)
que lista a árvore usada no alinhamento e todas as sequências envolvidas. Padrões
para ligado. use --notrust para desconfiar das tags TBA (tecnicamente, esses dados não fazem parte do
especificação do formato de arquivo e é apenas amontoado em comentários que a TBA produz, mas
pode não estar presente ou ser preciso em todos os arquivos MAF, portanto, oferecemos a opção de
desconfie disso).
--ordenar
Classifique as sequências encontradas por --trust (de modo a corresponder à saída que teria
aconteceu com --notrust).
Use maf2anchors.pl online usando serviços onworks.net