Este é o comando maskAlignedReads que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
maskAlignedReads.py - Máscara leituras alinhadas no arquivo de regiões
DESCRIÇÃO
uso: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
Use in.cmp.h5 para mascarar regiões correspondentes de arquivos em in.rgn.h5, grave a saída em um novo
rgn.ffn.
posicional argumentos:
inCmpFile
Um arquivo de entrada cmp.h5.
inRgnFofn
Um fofn de arquivos de tabela de região de entrada.
outRgnFofn
Um fofn de arquivos de tabela de região de saída.
opcional argumentos:
-h, --Socorro
mostre esta mensagem de ajuda e saia
-v, --versão
mostrar o número da versão do programa e sair
-l ARQUIVO DE LOG, --arquivo de log ARQUIVO DE LOG
Especifique um arquivo para fazer logon. O padrão é stderr. (padrão: nenhum)
-d, --depurar
Aumenta o detalhamento do registro (padrão: Falso)
-i, --informações
Exibir entradas de registro informativas (padrão: Falso)
Use maskAlignedReads online usando serviços onworks.net
