Este é o comando plotcone que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
plotcon - Conservação do gráfico de um alinhamento de sequência
SINOPSE
plotcon -seqüências conjunto de sequências [-arquivo de pontuação matriz] -winsize número inteiro -gráfico xigrafo
plotcon -Socorro
DESCRIÇÃO
plotcon é um programa de linha de comando da EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Suite de software ”). Faz parte do (s) grupo (s) de comando "Alinhamento: Vários".
OPÇÕES
Entrada seção
-seqüências conjunto de sequências
Arquivo contendo um alinhamento de sequência
-arquivo de pontuação matriz
Este é o arquivo de matriz de pontuação usado ao comparar sequências. Por padrão, é o
arquivo 'EBLOSUM62' (para proteínas) ou o arquivo 'EDNAFULL' (para sequências nucleicas). Esses
os arquivos encontram-se no diretório 'data' da instalação do EMBOSS.
Exigido seção
-winsize número inteiro
Número de colunas para ultrapassar a qualidade de alinhamento média. Quanto maior for esse valor, o
mais suave será o enredo. Valor padrão: 4
saída seção
-gráfico xigrafo
Use plotcone online usando serviços onworks.net
