Este é o comando propka que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
propka - Protonate arquivos PDB baseados em pKa
SINOPSE
propka PROPKATMP1
DESCRIÇÃO
propka automatiza a protonação (posicionamento de íons de hidrogênio) para uma estrutura em PDB
formato para qualquer valor pKa fornecido. O arquivo a ser usado deve ser nomeado PROPKATMP1 no
diretório onde o propka é executado.
propka irá gerar dois arquivos de saída chamados PROPKATMP2 e PROPKATMP3. PROPKATMP2
contém a estrutura resultante no formato PDB. PROPKATMP3 contém um resumo do
propka executar.
CITANDO PROPKA
Reconheça o uso de propka citando:
Hui Li, Andrew D. Robertson e Jan H. Jensen: Predição empírica muito rápida e
Interpretação de Valores de pKa de Proteínas, Proteínas, 2005, 61, 704-721.
SITE SERVIÇO
O PropKa pode ser usado por meio de uma interface da web em http://propka.ki.ku.dk/.
Use propka online usando serviços onworks.net
