Este é o comando vcf-phased-join que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online Windows ou emulador online MAC OS
PROGRAMA:
NOME
vcf-phased-join - pega vários pedaços pré-faseados sobrepostos e os concatena em
um VCF
SINOPSE
vcf-phased-join [OPÇÕES] A.vcf B.vcf C.vcf
DESCRIÇÃO
Sobre: o script pega vários pedaços pré-faseados sobrepostos e os concatena em
um VCF
usando chamadas heterozigotas das sobreposições para determinar a fase correta.
OPÇÕES
-j, --min-join-qualidade
Limiar de qualidade para colar os blocos pré-faseados juntos [10]
-l, --Lista
Lista de VCFs para ingressar.
-o, --resultado
Nome do arquivo de saída. Quando "-" é fornecido, STDOUT e STDERR serão usados
-q, --min-PQ
Quebre os segmentos pré-faseados se o valor PQ for inferior nos VCFs de entrada [0.6]
-h, - ?, --Socorro
Esta mensagem de ajuda
Use vcf-phased-join online usando serviços onworks.net
