Este é o aplicativo Linux denominado 123VCF, cuja versão mais recente pode ser baixada como 123VCF_binary.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado 123VCF com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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123VCF
DESCRIÇÃO
O 123VCF foi desenvolvido para tornar a etapa de filtragem de arquivos VCF mais confiável e eficiente.
Ele pode ser usado na etapa mais importante de sequenciamento de exoma completo e análise de dados de sequenciamento de genoma completo na pesquisa e também em configurações clínicas.
Ele apenas obtém o arquivo de pedido de filtragem e o arquivo de variantes e, em seguida, filtra as variantes com base no que você solicitou por meio do arquivo de pedido de filtragem.
Manual do usuário:
https://dl.adbioinformatics.net/123VCF/123VCF_Manual.ver1.pdf
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Autores: Milad Eidi, Samaneh Abdolalizadeh, Soheila Moeini
Orientadores: Javad Zahiri, PhD - Masoud Garshasbi, PhD
Recursos
- Interface gráfica do usuário
- Fácil de usar
- Fácil de entender
- Arquivos VCF compactados ou não compactados como entrada
- Variantes sobreviventes presentes no formato VCF, formato separado por tabulações
- 123VCF coloca as mesmas variantes de recurso BED quando o usuário define um filtro BED próximo um do outro em um arquivo TSV para detectar possíveis variantes heterozigóticas compostas
Público
Educação, usuários finais avançados, usuários finais/desktop, testadores
Interface com o usuário
Java swing
Linguagem de Programação
Java
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/project123vcf/. Ele foi hospedado em OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
