Este é o aplicativo Linux denominado ArtificialFastqGenerator, cuja versão mais recente pode ser baixada como ArtificialFastqGenerator_19_05_2015.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado ArtificialFastqGenerator com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
Gerador ArtificialFastq
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DESCRIÇÃO
ArtificialFastqGenerator leva o genoma de referência (no formato FASTA) como entrada e produz arquivos FASTQ artificiais no formato Sanger. Ele pode aceitar pontuações de qualidade base Phred de arquivos FASTQ existentes e usá-los para simular erros de sequenciamento. Uma vez que os FASTQs artificiais são derivados do genoma de referência, o genoma de referência fornece um padrão-ouro para chamar variantes (polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e inserções e deleções (indels)). Isso permite a avaliação de um pipeline de análise de Sequenciamento de Próxima Geração (NGS) que alinha as leituras com o genoma de referência e, em seguida, chama as variantes.Público
Indústria de saúde, ciência / pesquisa, usuários finais avançados
Linguagem de Programação
Java
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/artfastqgen/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
