Este é o aplicativo Linux chamado Autoprime cuja última versão pode ser baixada como autoprime.2.1.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Autoprime com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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Preparação automática
DESCRIÇÃO
O AutoPrime permite criar primers rapidamente para medição de PCR em tempo real da expressão eucariótica.
Ao conectar-se ao banco de dados EnsEMBL, as informações da estrutura do gene são usadas para encontrar primers que ultrapassam as fronteiras do exon. Desta forma, apenas sequências expressas são capturadas. Além disso, o mispriming em regiões repetitivas pode ser evitado usando informações do RepBase.
Funcionalidades
- Projeto de primer automatizado
- Controle de qualidade por meio de configurações detalhadas
- Usando fontes conhecidas: Primer3, EnsEMBL, RepBase
- Criando suas cartilhas desde 2003
- Site funcionando como um serviço
- Código Perl disponível para execução local
Público
Ciência / pesquisa, usuários finais avançados
Interface com o usuário
Baseado na Web, linha de comando
Linguagem de Programação
Perl
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/autoprime/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.