Este é o aplicativo Linux denominado CUSHAW3: Alinhamento preciso de leitura curta para execução no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como cushaw3-v3.0.3.tar.bz2. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado CUSHAW3: Alinhamento preciso de leitura curta para executar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
CUSHAW3: Alinhamento preciso de leitura curta para executar no Linux online
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DESCRIÇÃO
CUSHAW3 é um alinhador de leitura curta paralelizado, sensível e preciso de código aberto. Este alinhador propõe uma abordagem geral para alinhar adequadamente as leituras fáceis e difíceis para grandes genomas, como o genoma humano. Realize a avaliação em reais de qualidade de alinhamento que CUSHAW3 supera consistentemente CUSHAW2, BWA-MEM, Bowtie2 e GEM em termos de alinhamento de extremidade única e emparelhada. Além disso, nosso alinhador demonstrou melhor desempenho de alinhamento de extremidade emparelhada do que Novalign3 para leituras curtas com altas taxas de erro.Interface com o usuário
Console / Terminal
Linguagem de Programação
C + +
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/cushaw3/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
