Este é o aplicativo Linux denominado GenoCline, cuja versão mais recente pode ser baixada como GenoCline-1.5.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado GenoCline com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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GenoCline
DESCRIÇÃO
Identificação de clines a partir de bases de dados de freqüência de alelos ou genoma. Transformação angular. Função sigmóide.
Parametrização de um cline: orientação, coeficiente de correlação produto-momento de Pearson, regressão linear e sigmóide e coeficiente de determinação. Representação gráfica do cline. Limites de confiança.
Autocorrelação espacial. Índice de Moran.
Isolamento por distância. Regressão exponencial. Correlação Fst / Distância.
Método centróide.
Heterozigosidade esperada vs. predita de Cline.
MDS. Projeção Sammon.
Distâncias geográficas. Fst distâncias.
Exporte dados para Arlequin, Phylip, Past e Poptree.
Dados de entrada fáceis de usar.
Funcionalidades
- Identificação de clines a partir de bases de dados de freqüência de alelos ou genoma. Transformação angular. Função sigmóide.
- Parametrização de um cline: orientação, coeficiente de correlação produto-momento de Pearson, regressão linear e sigmóide e coeficiente de determinação.
- Representação gráfica do cline. Limites de confiança.
- Autocorrelação espacial. Índice de Moran. Isolamento por distância. Regressão exponencial. Correlação Fst / Distância. Método centróide. Heterozigosidade esperada vs. predita de Cline. MDS. Projeção Sammon. Distâncias geográficas. Fst distâncias.
- Exporte dados para Arlequin, Phylip, Past e Poptree.
- Dados de entrada fáceis de usar.
Público
Ciência / Pesquisa, Educação
Interface com o usuário
Java swing
Linguagem de Programação
Java
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/genocline/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
