Este é o aplicativo Linux chamado HomSI, cuja versão mais recente pode ser baixada como HomSI.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online gratuitamente este aplicativo chamado HomSI com OnWorks.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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HomSI
DESCRIÇÃO
Em famílias consanguíneas, por herdarem os mesmos segmentos genômicos de ambos os pais, os indivíduos apresentam trechos de seus genomas homozigotos. Essa situação leva à prevalência de doenças recessivas entre os membros dessas famílias. O mapeamento da homozigosidade é baseado nesta observação e vários genes de doenças recessivas foram descobertos com a ajuda desta técnica em famílias consanguíneas. Os pesquisadores normalmente usam matrizes SNP para determinar as regiões homozigóticas e, em seguida, pesquisar o gene da doença por meio do sequenciamento dos genes dentro desse loci de doença candidato. Recentemente, o advento do sequenciamento de última geração permite a identificação simultânea de regiões homozigotas e a detecção de mutações relevantes para o diagnóstico, usando dados de um único experimento de sequenciamento. A este respeito, desenvolvemos uma nova ferramenta que identifica regiões homozigóticas usando dados de sequência profunda. Usando arquivos * .vcf como um arquivo de entrada, nosso programa identifica o majo
Recursos
- Mapeamento de homozigose em dados NGS
Interface com o usuário
JavaSWT
Linguagem de Programação
Java
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/homsi/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
