Este é o aplicativo Linux chamado miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) para rodar no Linux online, cuja última versão pode ser baixada como mirnaTA_v1.2.3.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) para rodar no Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
CAPTURAS DE TELA:
miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) para rodar no Linux online
DESCRIÇÃO:
O microRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) é uma ferramenta de bioinformática que pode ser usada para identificar miRNAs diferencialmente expressos em estudos temporais. Ele é implementado no pacote Perl e R (>= 2.13.0) e pode ser executado em várias plataformas, como Linux, Mac e Windows. O mirnaTA exige que os usuários forneçam dados de no mínimo dois pontos de tempo e analisem até 20 pontos de tempo. Para normalizar os dados e remover a variabilidade técnica, foi utilizada a Transformação Quantílica Normal (NQT) e os dados normalizados são analisados usando o modelo de regressão linear para localizar quaisquer miRNAs que são expressos diferencialmente de maneira linear. Quaisquer miRNAs com valor P<0.05 são considerados estatisticamente significativos. Os miRNAs restantes que não se encaixam no modelo linear são analisados em dois métodos diferentes: (1) se o número de pontos de tempo <3, CDF da distribuição normal e (2) se o número de pontos de tempo for >= 3, ANOVA é utilizada.http://www.gigasciencejournal.com/content/3/1/20
Funcionalidades
- Analisador Temporal de miRNA
- Transformação Quantílica Normal (NQT)
- até 20 pontos de tempo
- Pacote R
- Perl
- mapa de calor
- fácil de executar
- interface gráfica HTML
- saída simples
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Perl
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/mirnata/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.