Este é o aplicativo Linux chamado MspJI-seq_pipeline1.0 cuja versão mais recente pode ser baixada como pipeline1.0.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado MspJI-seq_pipeline1.0 com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
MspJI-seq_pipeline1.0
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DESCRIÇÃO
MspJI-seq_pipeline1.0 é um pipeline para sequenciamento de digestão de MspJI no estudo de metilação de DNA. A digestão com endonuclease de restrição dependente de modificação MspJI acoplada com sequenciamento de próxima geração pode estimar o estado de metilação da localização da citosina "CNNR" no genoma mapeando leituras de alto rendimento para as sequências de referência. MspJI-seq_pipeline1.0 foi projetado para ser um programa de mapeamento de propósito geral para lidar com essas características especiais de MspJI-seq. Seu alinhamento é baseado no programa de código aberto SOAP (Short Oligo Alignment Program), e o reconhecimento de sites mCNNR é realizado por expressão regular em perl.
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Perl
Ambiente de Banco de Dados
Arquivo plano
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/mspjiseqpipelin/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
