Este é o aplicativo Linux chamado OptimizeSNP, cuja versão mais recente pode ser baixada como Optimize1.0code.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado OptimizeSNP com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
Otimizar SNP
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DESCRIÇÃO
O programa aplica programação linear para minimizar o número de microarranjos e experimentos de hibridização que precisam ser realizados para cobrir a maioria dos SNP expressos previstos. Dependências :. 1) mampl.exe deve estar no PATH do sistema 2) CPLEX 12.2 deve estar instalado. cplexamp.exe deve estar no PATH do sistema
O mampl.exe pode ser obtido em qualquer programa que contenha AMPL. Eu obtive AMPL da versão de teste do MOSEK em http://www.mosek.com/. CPLEX 12.0 pode ser obtido em http://www-01.ibm.com/software/integration/optimization/cplex-optimizer/. Uma licença acadêmica gratuita pode ser obtida preenchendo o formulário de iniciativa acadêmica da IBM.
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Perl
Ambiente de Banco de Dados
Arquivo plano
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/optimizesnp/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
