Este é o aplicativo Linux denominado PARSEC - PAtteRn SEarch / Context para ser executado no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como PARSEC_Deployment_Package_v2.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado PARSEC - PAtteRn SEarch / Context para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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PARSEC - PAtteRn SEarch / Contexto para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
A caracterização de sítios genômicos é um grande desafio na compreensão e exploração de dados de sequenciamento de próxima geração. A maioria dos sítios genômicos são representados por motivos curtos e degenerados com uma distribuição espalhada e às vezes com função biológica (ex: regulação da expressão gênica, padrões de splicing ou sinais epigenéticos). Esses motivos estão associados a uma grande quantidade de ruído e, portanto, o desenvolvimento de uma plataforma computacional para detecção precisa de sítios genômicos requer a integração de vários dados biológicos em grande escala a fim de filtrar falsos positivos.PARSEC representa uma solução intuitiva, modular (facilmente extensível) e tudo-em-um para a integração eficiente de muitas informações genômicas diversas, a fim de realizar a localização não linear e caracterização de sítios biológicos em um ambiente amigável.
Consulte o wiki para obter os requisitos de hardware e navegadores compatíveis.
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Baseado na Web-
Linguagem de Programação
C ++, Java
Ambiente de Banco de Dados
JDBC, MySQL, PostgreSQL (pgsql)
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
