Este é o aplicativo Linux denominado RGAAT para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como RGAAT.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado RGAAT para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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RGAAT para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
Este programa pode montar e / ou anotar genoma para novo genoma e atualização de genoma conhecido usando arquivo de alinhamento de sequência (formato SAM ou BAM), arquivo de variante de sequência (formato VCF ou tabela de cinco colunas (delimitado por tabulação, incluindo cromossomo, posição, id, referência alelo e alelo alternativo)) ou novo arquivo de sequência de genoma (formato FASTA) com base no arquivo de sequência de genoma de referência (formato FASTA) e arquivo de anotação (formato TBL, GTF, GFF, GFF3 ou BED).Recursos
- identificação de variação de sequência
- construção de sequência de consenso de genoma
- modificação do genoma
- comparação do genoma
- anotação de genoma
- construção de conversão de coordenadas de genoma entre diferentes versões de montagem de genoma
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Perl
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/rgaat/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
