Este é o aplicativo Linux chamado scFvMiner para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como scFvMiner.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado scFvMiner para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
scFvMiner para rodar em Linux online
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DESCRIÇÃO
Esses scripts escritos em java podem ser usados para análise de sequenciamento profundo dos anticorpos scFv de uma biblioteca de anticorpos sintéticos e produz informações de sequência completas nas áreas randomizadas de anticorpos enriquecidos da biblioteca por exibição de fago. Os métodos são descritos em Lövgen, J., Pursiheimo, JP, Pyykkö, M., Salmi, J. & Lamminmäki, U. (2016) Sequenciamento de próxima geração de todos os loops variáveis de scFv de estrutura única sintética - aplicação em anticorpo anti-HDL seleções. New Biotechnology 33: 790-796.Recursos
- sequenciamento de próxima geração
- Loops de CDR
Linguagem de Programação
Java
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/scfvminer/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
