Este é o aplicativo Linux denominado Seal, cuja versão mais recente pode ser baixada como seal-0.4.0-rc2.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Seal with OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
Selar
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DESCRIÇÃO
Seal é um kit de ferramentas de análise e alinhamento de leitura curta distribuído baseado em Hadoop. Atualmente o Seal inclui ferramentas para: desmultiplexação de leitura, alinhamento de leitura, remoção de leitura duplicada, classificação de mapeamentos de leitura e cálculo de estatísticas para recalibração de qualidade de base empírica. Balanças de selagem, manipulação fácil de TB de dados.Funcionalidades
- alinhamento de leitura curta (com base em BWA)
- identificação de leitura duplicada
- classificar mapeamentos de leitura
- calcular tabelas de recalibração de qualidade de base empírica
- rápido, escalonável, confiável (roda em Hadoop)
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/biodoop-seal/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
