Este é o aplicativo Linux chamado SmithWaterman para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como smith_waterman-0.2.3.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado SmithWaterman para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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SmithWaterman para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
MOVIDO PARA GITHUB: https://github.com/noporpoise/seq-alignUma implementação do algoritmo de alinhamento de sequência local Smith-Waterman.
Veja o alinhamento global do nosso projeto irmão usando Needleman-Wunsch:
http://sourceforge.net/projects/needlemanwunsch/
Recursos
- Penalidades de gap afim
- Saída colorida
- Lê FASTA, FASTQ e arquivos de sequência simples (incluindo arquivos gzip)
- Matrizes de substituição de DNA / proteína predefinidas (PAM / BLOSUM etc)
- Pode carregar matrizes de substituição de penalidade
- Código C portátil que pode ser usado em outros projetos de bioinformática
Público
Ciência / Pesquisa, Educação
Interface com o usuário
Console / Terminal, linha de comando
Linguagem de Programação
C ++, C
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/smithwaterman/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
