Este é o aplicativo Linux denominado TagGraph, cuja versão mais recente pode ser baixada como WindowsDockerTG.1.8.1.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado TagGraph com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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TagGraph
DESCRIÇÃO
Embora a espectrometria de massa seja bem adequada para identificar milhares de modificações pós-traducionais de proteínas (PTMs), ela tem sido historicamente tendenciosa para apenas algumas. Para medir todo o conjunto de PTMs em diversos proteomas, o software deve superar o duplo desafio de cobrir enormes espaços de busca e distinguir interpretações de espectro corretas de incorretas. Aqui, descrevemos o TagGraph, uma ferramenta computacional que supera os dois desafios com um método de pesquisa irrestrito baseado em string que é 350 vezes mais rápido do que as abordagens existentes e um modelo de validação probabilística que otimizamos para atribuições de PTM. Aplicamos TagGraph a um conjunto de dados de proteômica humana publicado de 25 milhões de espectros de massa e triplicamos as identificações de espectro de confiança em comparação com sua análise original. Identificamos milhares de tipos de modificação em quase 1 milhão de locais no proteoma.Recursos
- Definindo proteomas complexos com string
Público
Educação
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Python
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/taggraph/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
