Este é o aplicativo do Windows denominado dataMAPPs para execução no Windows online sobre Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como dataMAPPs_3.2.7.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado dataMAPPs para rodar no Windows online no Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
SCREENSHOTS
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dataMAPPs para rodar no Windows online sobre Linux online
DESCRIÇÃO
dataMAPPs permite o processamento rotineiro e eficiente de dados de estudos de imunogenicidade aplicando a tecnologia de peptidomics MAPPs para detectar potenciais epítopos MHCI- ou MHC-II apresentados por células dendríticas (DC).Possui controle de qualidade dos dados brutos, normalização entre amostras/doadores e visualização de resultados em um estilo de mapa de calor (heatMAPPs). O núcleo do dataMAPPs é uma biblioteca R genérica que pode ser adaptada a projetos específicos por meio de scripts de controle dedicados que também permitem o recálculo reproduzível dos resultados.
Consulte o arquivo README para instruções de instalação e uso. A documentação adicional é fornecida em formato PDF.
dataMAPPs é publicado sob licença GPL por uma equipe de cientistas que trabalham para a Hoffmann-La Roche AG em Basel, Suíça. O software é fornecido como está, para beneficiar outros pesquisadores.
Publicação em preparação:
Steiner et al, 'Ativando a Proteômica Peptídica Associada a MHC-II de Rotina (MAPPs) para Avaliação de Risco de Imunogenicidade Induzida por Drogas'
Funcionalidades
- importação de dados peptidomics (saída PEAKS, mas pode ser estendida)
- CQ de dados extensos e exclusão de amostras por pontos de corte definidos pelo usuário
- procedimento de normalização de 2 etapas dedicado para dados MAPPs
- mapeamento de peptídeos para anticorpo/proteína alvo
- agrupamento de posições de mapeamento de peptídeos em regiões de epítopos de hotspot
- visualização de resultados de mapeamento como mapas de calor
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Console / Terminal
Linguagem de Programação
B / R
Ambiente de Banco de Dados
Arquivo plano
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/datamapps/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.
