Este é o aplicativo do Windows chamado Dress Up RNA seq, cuja versão mais recente pode ser baixada como DressUp.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Dress Up RNA seq com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
SCREENSHOTS
Ad
Vestir Seq RNA
DESCRIÇÃO
O objetivo do DressUp é criar um pipeline de RNA seq de ponta a ponta, no qual todas as etapas de análise de dados de um sequenciador Illumina são realizadas em uma única etapa em um ambiente de HPC. Os programas de RNA seq incluídos são TopHat, CuffLinks, CuffDiff, CuffMerge, FastQC e corte usando o kit de ferramentas FastX.
DressUp facilita os programas de RNA seq simplificando vários pacotes em um único script. Esse script executa os programas de RNA seq em um sistema de cluster em lote. Após a execução do script, os trabalhos são enviados ao cluster, dependendo dos atributos definidos no arquivo de configuração.
As opções do programa podem ser modificadas no script principal "DressUp" e as opções do PBS podem ser modificadas no diretório HeaderFiles.
Recursos
- CuffMerge, corte FastX e FastQC podem ser ligados ou desligados no arquivo de configuração
- Scripts PBS separados para cada componente do pipeline disponível
- Vários programas de RNA seq executados em uma etapa
- Capacidade de ajustar as opções de PBS para cada programa
Público
Ciência / Pesquisa
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/dressuprnaseq/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
