Este é o aplicativo do Windows chamado YeastpRofile para ser executado no Windows online sobre o Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como YeastpRofile_V.2.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado YeastpRofile para rodar no Windows online sobre Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
SCREENSHOTS
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YeastpRofile para rodar no Windows online sobre Linux online
DESCRIÇÃO
YeastpRofile é um aplicativo de formulário Windows portátil, escrito em C#, para calcular o perfil de uma variável genômica em torno dos locais de início de transcrição (TSS) e término (TTS) de mRNAs de levedura. O perfil é obtido calculando o coeficiente de correlação de Pearson em todo o genoma (R) entre os valores das variáveis genômicas e as contagens de TSS (ou TTS) no deslocamento incremental da fita transcrita. Os dados das contagens de TSS e TTS usados para calcular os perfis foram retirados do trabalho de Pelechano et al. (1). O arquivo de entrada deve ser um arquivo formatado BedGraph com base na versão R64 da sequência do genoma de levedura. O arquivo de saída é uma tabela delimitada por tabulação de texto que relata valores R para os vários deslocamentos de coordenadas variáveis em relação a TSS ou TTS. R relacionado a cada fita também é relatado para verificar se um perfil semelhante é obtido nas duas direções de transcrição.1) V. Pelechano, W. Wei, LM Steinmetz, Heterogeneidade transcricional extensa revelada por perfil de isoforma, Nature, 497 (2013) 127-13.
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
C#
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/yeastprofile/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.
