Aceasta este comanda altree-add-Sp care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
altree-add-S - Titlu...
REZUMAT
altree-add-S [opțiuni]
Opțiuni:
--version versiunea programului
--short-help|h mesaj scurt de ajutor
--help mesaj de ajutor cu descrieri de opțiuni
--man documentatie completa
--first-input-file|i fișierul de intrare 1
--second-input-file|j fișier de intrare 2 date referitoare la trăsătură (calitative sau cantitative)
--output-file|o fișier de ieșire
--epsilon|e epsilon valoare
--data-type|t tip de date: SNP sau ADN
--proportion|p proporție de cazuri din eșantion (numai pentru date calitative)
--data-qual|q tip de date: calitative sau cantitative
[--outgroup|g] numele grupului extern
--low|l dacă un haplotip este prezent egal sau mai mic de -l ori, starea lui S va fi setată la "?"
OPŢIUNI
--versiune
Tipăriți versiunea programului și iese.
--ajutor-scurt
Imprimați un scurt mesaj de ajutor și ieșiți.
--Ajutor Imprimați un mesaj de ajutor cu descrieri ale opțiunilor și ieșiri.
--om Imprimă pagina de manual și iese.
--first-input-file|i
Fișierul de intrare 1 (fișier paup sau phylip)
--second-input-file|j
Fișierul de intrare 2, conține de câte ori un haplotip dat este transportat în funcție de caz
și indivizii de control (date calitative) sau valorile cantitative
care corespunde unui haplotip dat (date cantitative)
--output-file|o
Fisier de iesire
--epsilon|e
parametru espilon (vezi formula din documentație)
--tip-date|t
Tip de date: ADN (ATGCU) sau SNP (0-1)
--proporție|p
Proporția indivizilor caz în eșantion
--outgroup|g
Numele grupului extern (dacă nu se află în fișierul care conține numărul de cazuri și
controale pe haplotip)
--data-qual|q
Specificați dacă datele sunt calitative sau cantitative
--jos|l dacă un haplotip este prezent egal sau mai mic de -l ori, starea lui S va fi setată
la "?"
DESCRIERE
Acest program adaugă un nou caracter (numit „caracter S”) fiecărui haplotip din intrare
dosar în funcție de numărul de dosare și controale care îl poartă.
Utilizați altree-add-Sp online folosind serviciile onworks.net