asn2fsa - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

asn2fsa - convertiți datele secvenței biologice din ASN.1 în FASTA

REZUMAT

asn2fsa [-] [-A ACC] [-D] [-E] [-H] [-L nume de fișier] [-T] [-a tip] [-b] [-c] [-d cale]
[-e N] [-f cale] [-g] [-h nume de fișier] [-i nume de fișier] [-k] [-l] [-m] [-o nume de fișier] [-p cale]
[-q nume de fișier] [-r] [-s] [-u] [-v nume de fișier] [-x str] [-z]

DESCRIERE

asn2fsa convertește datele secvenței biologice din ASN.1 în FASTA.

OPŢIUNI

Un rezumat al opțiunilor este inclus mai jos.

- Imprimați mesajul de utilizare

-A ACC Aderare la preluare

-D Folosiți Dash pentru Gap

-E Seq-id-uri extinse

-H HTML se întinde

-L nume de fișier
Fișier jurnal

-T Utilizați fire

-a tip
Tip de intrare ASN.1:
a Automat (implicit)
z Oricare
e Seq-intrare
b Bioseq
s Bioseq-set
m Seq-submit
t procesare lot (potrivit pentru lansările oficiale; detectează automat tipul specific)

-b Bioseq-set este binar

-c Bioseq-set este comprimat

-d cale
Calea către baza de date ReadDB

-e N Lungimea liniei (70 în mod implicit; poate varia de la 10 la 120)

-f cale
Calea către datele FASTA indexate

-g Extindeți golurile delta în Ns

-h nume de fișier
Numele fișierului de ieșire din memoria cache a componentei îndepărtate

-i nume de fișier
Fișier de intrare unic (intrare standard în mod implicit)

-k Preluare locală

-l Blocați componentele în avans

-m Stilul principal pentru secvențe aproape segmentate

-o nume de fișier
Nume fișier de ieșire nucleotidă

-p cale
Calea către fișierele ASN.1

-q nume de fișier
Numele fișierului de ieșire pentru scorul de calitate

-r Preluare de la distanță de la NCBI

-s Contig genomic departe pentru scoruri de calitate

-u Recurs

-v nume de fișier
Numele fișierului de ieșire a proteinelor

-x str Subșir de selecție a fișierului (.ent implicit) [Șir]

-z Scorul de calitate a imprimării decalaj ca -1

Utilizați asn2fsa online folosind serviciile onworks.net