Aceasta este comanda createChemistryHeader care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
createChemistryHeader.py - Creați un antet SAM cu chimia de secvențiere PacBio
informații
DESCRIERE
utilizare: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_FILES ...]
fișier de aliniere_input fișierul_header_ieșire
createChemistryHeader creează un antet SAM care conține informațiile chimice utilizate de
Tolbă.
pozitional argumente:
fişier_de_aliniere_intrare
Un fișier SAM sau BAM produs de BLASR.
fișierul_antet_ieșire
Numele fișierului antet SAM sau BAM care va fi creat cu informații de chimie
încărcat.
facultativ argumente:
-h, --Ajutor
afișați acest mesaj de ajutor și ieșiți
--depanare
Ieșiți informații detaliate ale jurnalului. (implicit: fals)
--bas_files BAS_FILES [BAS_FILES ...]
Fișierele bas sau bax care conțin citirile care au fost aliniate în
fişier_de_aliniere_intrare. De asemenea, poate fi o serie de fișiere bas sau bax. (implicit: niciunul)
Utilizați createChemistryHeader online folosind serviciile onworks.net