Aceasta este comanda famap care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
famap - pregătiți baza de date de secvențe Fasta pentru căutări re-PCR
REZUMAT
famap [-hV] -b mmapped-file [-t cvt] [fafile ...]
famap [-hV] -d mmapped-file [comanda ...]
famap [-hV] -l mmapped-file [comanda ...]
DESCRIERE
Programul famap face parte din suita e-PCR și este utilizat pentru a construi fișiere mmapped din FASTA
fișiere pentru căutări inverse e-PCR
OPŢIUNI
unde cvt (tabelul de conversie) este unul dintre:
oprit - așa cum este (implicit)
n - nucleotidă [acgtnACGTN] permisă,
N - nucleotide majuscule permise [ACGTN]
nx - nucleotidă cu coduri de ambiguitate permise
NX - nucleotidă cu coduri de ambiguitate majuscule
EXEMPLU
famap -tN -b genomul.famap org/chr_*.fa
fahash -b genome.hash -w 12 -f3 ${PWD}/genome.famap
re-PCR -s genom.hash -n1 -g1 ACTATTGATGATGA AGGTAGATGTTTTT 120-200
Vedea famap(1) și re-pcr(1)
Utilizați famap online folosind serviciile onworks.net
