Aceasta este comanda fastatool care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
fastatool - Oferă a set of Unelte util cand de lucru cu RAPID fișiere.
DESCRIERE
Acest program face parte din pachetul de asamblare MIRA. Fastatool oferă un set de instrumente
util atunci când lucrați cu fișiere de urmărire FASTA.
Vă rugăm să consultați documentația de mai jos pentru informații mai detaliate.
REZUMAT"
fastatool <instrument parametrii>
OPŢIUNI
clip Clipează bazele din stânga și din dreapta unei secvențe FASTA, scrie rezultatul în STDOUT.
Utilizare:
clipFASTA -l leftclip -r rightclip fastinfile
steriliza
Șterge secvențe cu baze non-IUPAC sau secvențe goale dintr-un fișier FASTA, scrie
secvențele „supraviețuitoare” la un fișier nou. Dacă este dat un fișier de calitate, un fișier curățat
este scrisă și versiunea acesteia. Secvențele din fișierele de calitate (dacă sunt date)
TREBUIE să fie în aceeași ordine ca în fișierul fasta.
Utilizare:
sanitizeFASTA fastinfile fastaoutfile [fastaqualin fastaqualoutfile]
Utilizați fastatool online folosind serviciile onworks.net
