fastx_trimmer - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

fastx_trimmer - Trimmer FASTA/Q

DESCRIERE

utilizare: fastx_trimmer [-h] [-f N] [-l N] [-t N] [-m MINLEN] [-z] [-v] [-i INFILE] [-o
OUTFILE] O parte din FASTX Toolkit 0.0.14 de A. Gordon ([e-mail protejat])

[-h] = Acest ecran de ajutor util.

[-f N] = Prima bază de păstrat. Implicit este 1 (=prima bază).

[-l N] = Ultima bază de păstrat. Implicit este citirea integrală.

[-t N] = Trim N nucleotide de la sfârșitul citirii.

„-t” nu poate fi folosit cu „-l” și „-f”.

[-m MINLEN]
= Cu [-t], eliminați citirile mai scurte decât MINLEN.

[-z] = Comprimați ieșirea cu GZIP.

[-i INFILE]
= fișier de intrare FASTA/Q. implicit este STDIN.

[-o OUTFILE] = fișier de ieșire FASTA/Q. implicit este STDOUT.

Utilizați fastx_trimmer online folosind serviciile onworks.net