Aceasta este comanda lastdb care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
lastdb - compararea la scară a genomului a secvențelor biologice
REZUMAT
lastdb [Opțiuni] nume-ieșire fișiere-secvență-fasta
DESCRIERE
Pregătiți secvențele pentru alinierea ulterioară cu lastal.
OPŢIUNI
Principal Opţiuni
-h, --Ajutor
afișați toate opțiunile și setările lor implicite și ieșiți
-p interpretează secvențele ca proteine
-R opțiuni de marcare repetată (implicit=10)
-c masca moale litere mici
Avansat Opţiuni (Mod implicit setări)
-Q format de intrare: 0=fasta, 1=fastq-sanger, 2=fastq-solexa, 3=fastq-illumina (0)
-s dimensiunea volumului (nelimitat)
-m model de semințe (non-ADN: 1)
-u schema de însămânțare (ADN: YASS)
-w pas index (1)
-a alfabet definit de utilizator
-i limita minimă a potrivirilor inițiale pe poziție de interogare (0)
-b adâncimea cupei
-C tip tabel copil: 0 = niciunul, 1 = dimensiunea octetului, 2 = dimensiunea scurtă, 3 = complet (0)
-x doar numărați secvențele și literele
-v fii verbos: scrie mesaje despre ceea ce face lastdb
-V, --versiune
afișați informațiile despre versiune și ieșiți
RAPORTAREA GANDACI
Raportați erori la: [e-mail protejat]
ULTIMA pagină de pornire: http://last.cbrc.jp/
Utilizați lastdb online folosind serviciile onworks.net
