mia-3dddistance-stats - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

mia-3dddistance-stats - Evaluează statisticile de distanță pentru două imagini etichetate.

REZUMAT

mia-3dddistance-stats -i -r -o [Opțiuni]

DESCRIERE

mia-3dddistance-stats Acest program este folosit pentru a evalua distanța dintre egal
zone etichetate în două imagini. Fișierul de ieșire este un fișier csv care conține distanțele pentru
fiecare coordonată etichetată din imaginea de test în următoarea formă:

etichetă,n-eșantioane,distanță,distanță,...

Ar arăta un program R simplu pentru a obține unele statistici pe etichetă din aceste date

args <- commandArgs(TRUE)
date <- read.csv(args[1], header=FALSE)
pentru ( i in 1:dim(date)[1] ) {
linia <- date[i,]
label <- as.integer(linia[1])
interval_final <- 2 + as.numeric(linie[2])
s <- as.numeric(line[3:end_range])
rezultat <- sprintf ("%d %8.4f %8.4f %8.4f %8.4f0
etichetă, medie(e), sqrt(var(e), mediană(e), max(e))
pisica (rezultat)
}

OPŢIUNI

Fișier-IO
-i --in-labels=(input, obligatoriu); io
imagine etichetă de intrare Pentru tipurile de fișiere acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/io

-r --ref-labels=(input, obligatoriu); io
imagine etichetă de referință Pentru tipurile de fișiere acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/io

-l --label-map=(input); şir
maparea opțională a numerelor de etichetă

-o --out-file=(ieșire, obligatorie); şir
numele fișierului de ieșire la care să scrieți distanțele. Fișierul de ieșire este un fișier csv,
care conțin distanțele enumerate pentru fiecare etichetă.

Ajutor & Info
-V --verbose=avertisment
verbozitatea rezultatelor, mesaje tipărite de nivel dat și priorități mai mari.
Prioritățile acceptate începând de la cel mai de jos nivel sunt:
info ‐ Mesaje de nivel scăzut
urmări ‐ Urmărirea apelului de funcție
eşua ‐ Raportați eșecurile testelor
de avertizare - Avertizări
eroare - Raportează erori
depana - Ieșire de depanare
mesaj ‐ Mesaje normale
fatal ‐ Raportați numai erori fatale

--drepturi de autor
tipăriți informații despre drepturile de autor

-h --ajutor
imprimați acest ajutor

-? --utilizare
imprimați un scurt ajutor

--versiune
tipăriți numărul versiunii și ieșiți

Prelucrare
--fire=-1
Numărul maxim de fire de execuție de utilizat pentru procesare, acest număr ar trebui să fie mai mic
sau egal cu numărul de nuclee de procesor logic din mașină. (-1:
estimare automată). Numărul maxim de fire de execuție de utilizat pentru procesare, Aceasta
numărul trebuie să fie mai mic sau egal cu numărul de nuclee de procesor logic în
Mașina. (-1: estimare automată).

PLUG-URI: 3dimage/io

analiza Analizați imaginea 7.5

Extensii de fișiere recunoscute: .HDR, .hdr

Tipuri de elemente acceptate:
8 biți nesemnat, 16 biți semnat, 32 de biți semnat, 32 de biți în virgulă mobilă,
virgulă mobilă 64 de biți

pool de date IO virtuală către și de la pool-ul de date intern

Extensii de fișiere recunoscute: .@

dicom Seria de imagini Dicom ca 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .DCM, .dcm

Tipuri de elemente acceptate:
semnat pe 16 biți, nesemnat pe 16 biți

hdf5 HDF5 3D imagine IO

Extensii de fișiere recunoscute: .H5, .h5

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, semnat pe 64 de biți, nesemnat pe 64 de biți, flotant
punct 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

inria Imaginea INRIA

Extensii de fișiere recunoscute: .INR, .inr

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

mhd MetaIO 3D imagine IO folosind implementarea VTK (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

nifti Imagine 1D NIFTI-3 IO

Extensii de fișiere recunoscute: .NII, .nii

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, nesemnat pe 32 de biți, semnat pe 64 de biți, fără semn pe 64 de biți, virgulă mobilă 32
bit, virgulă mobilă 64 de biți

vff Format raster VFF Sun

Extensii de fișiere recunoscute: .VFF, .vff

Tipuri de elemente acceptate:
nesemnat pe 8 biți, semnat pe 16 biți

vista Vizualizare 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64
pic

VTI Imagine 3D VTK-XML de intrare și de ieșire (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .VTI, .vti

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

vtk Moștenire de intrare și de ieșire a imaginii 3D VTK (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64
pic

EXEMPLU

Evaluați distanțele pentru fiecare etichetă disponibilă în imagine.v față de etichetele corespunzătoare din
imaginea reference.v ans stochează rezultatul o listă de valori separată de coma, de exemplu
distante.csv.

mia-3dddistance-stats -i image.v -r reference.v -o distances.csv

AUTOR(i)

Gert Wollny

DREPTURI DE AUTOR

Acest software este Copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Germania și Madrid, Spania. Este vorba
FĂRĂ ABSOLUT NU GARANȚIE și o puteți redistribui conform termenilor GNU
LICENȚĂ PUBLICĂ GENERALĂ Versiunea 3 (sau ulterioară). Pentru mai multe informații rulați programul cu
opțiunea „--copyright”.

Utilizați mia-3dddistance-stats online folosind serviciile onworks.net