Aceasta este comanda propka care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
propka - Fișiere PDB Protonate bazate pe pKa
REZUMAT
propka PROPKATMP1
DESCRIERE
propka automatizează protonarea (poziționarea ionilor de hidrogen) la o structură în PDB
format pentru orice valoare pKa dată. Fișierul de utilizat trebuie să fie numit PROPKATMP1 în fișierul
directorul în care este rulat propka.
propka va genera două fișiere de ieșire numite PROPKATMP2 și PROPKATMP3. PROPKATMP2
conține structura rezultată în format PDB. PROPKATMP3 conține un rezumat al
propka alerga.
CITARE PROPKA
Vă rugăm să recunoașteți utilizarea de către dvs propka citând:
Hui Li, Andrew D. Robertson și Jan H. Jensen: Predicție empirică foarte rapidă și
Interpretarea valorilor pKa a proteinelor, Proteine, 2005, 61, 704-721.
WEB SERVICIU
PropKa poate fi utilizat printr-o interfață web la http://propka.ki.ku.dk/.
Utilizați propka online folosind serviciile onworks.net
