pymvpa2-ofmotionqc - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

pymvpa2-ofmotionqc - diagramă BOLD fMRI motion QC pentru un set de date OpenFMRI

REZUMAT

pymvpa2 ofmotionqc [--versiune] [-h] --cale PATH [-t ID] [--estimate-fname NUME]
[--relativ REF REF] [--exclude-subjs ID [ID ...]] [--comandă-deviz ETICHETA] [--rad2deg]
[--outlier-minthresh OUTLIER_MINTHRESH] [--outlier-stdthresh OUTLIER_STDTHRESH] [--savefig
SALVAȚI FIG]

DESCRIERE

Generați o diagramă QC pentru estimările de mișcare fMRI BOLD dintr-un set de date OpenFMRI.

Figura generată constă din două subploturi: una pentru translație și una pentru rotație.
Este reprezentată graficul L2-norma pentru fiecare tip de mișcare. Limitele rundelor sunt indicate cu linii
linii verticale. Sunt vizualizate următoarele statistici

1. Interval între subiecte (min, max) cu o zonă umbrită gri deschis

2. 50% percentilă în jurul mediei cu o zonă umbrită de gri mediu

3. Eroare standard a mediei (SEM; +/-) cu o zonă umbrită gri închis

4. Mediană între subiecți cu o linie neagră

5. Subiectele aberante sunt reprezentate ca linii roșii individuale

Valorile aberante sunt definite ca subiecte care depășesc pragul oriunde într-o serie dată. În
în acest caz, întreaga serie temporală a mișcării pentru acea rulare este reprezentată ca valori aberante. ID-uri pentru
valorile aberante detectate sunt tipărite pe consolă. Rețineți că aceste ID-uri nu țin cont
date lipsă sau subiecte excluse. Cu toate acestea, în cazul în care nu lipsesc date și nu sunt excluse
subiectele pe care le corespund cu ID-uri numerice ale subiectelor.

OPŢIUNI

--versiune
arată versiunea programului și informațiile despre licență și ieși

-h, --Ajutor, --help-np
afișați acest mesaj de ajutor și ieșiți. --help-np dezactivează forțat utilizarea unui pager
pentru afișarea ajutorului.

--cale PATH
calea către directorul rădăcină al setului de date OpenFMRI

-t ID, --sarcină ID
ID-ul sarcinii cu date fMRI îngroșate pentru diagrama QC. Implicit: 1

--estimate-fname NUME
numele fișierelor cu estimările de mișcare din fiecare folder de rulare a activității BOLD. Mod implicit:
bold_moest.txt

--relativ REF REF
Recodificați toate estimările ca diferență față de estimarea pentru volumul X din runda Y
(--relativ YX). Indici bazați pe zero!

--exclude-subjs AM FACUT ...]
lista de ID-uri de subiecte separate prin spații de exclus din analiza QC

--comandă-deviz ETICHETA
ordinea coloanelor estimărilor din dosare. `transrot` indică mai întâi traducerea,
urmată de rotație. `rottrans` se referă la ordinea opusă. Implicit: „transrot”

--rad2deg
Dacă se specifică, estimările de rotație sunt presupuse a fi în radiani și vor fi convertite
la grade.

--outlier-minthresh OUTLIER_MINTHRESH
pragul minim absolut de detectare a valorii aberante. Numai o valoare mai mare decât aceasta
pragul va fi considerat vreodată un valori abere. Implicit: niciunul

--outlier-stdthresh OUTLIER_STDTHRESH
pragul minim în unități de abatere standard pentru detectarea valorii aberante. Mod implicit:
Nici unul

--savefig SALVAȚI FIG
nume de fișier pentru a stoca cifra QC sub. Implicit: niciunul

Utilizați pymvpa2-ofmotionqc online folosind serviciile onworks.net