wossoupute - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

wossoutput - Găsește programe după datele de ieșire EDAM

REZUMAT

wosoutput -identificator şir [-exploda boolean] [-showkeywords boolean]
-sensibil boolean -subclase boolean - învechit boolean -grava boolean
-ambasadă boolean - showembassy şir -colon boolean -gui boolean
[-outfile outfile] [-html comutare] [-grupuri boolean] [-alfabetic boolean]

wosoutput -Ajutor

DESCRIERE

wosoutput este un program de linie de comandă de la EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Suita de software”). Face parte din grupul(e) de comandă „Ontologie:EDAM,Documentare”.

OPŢIUNI

Intrare secțiune
-identificator şir

Suplimentar secțiune
-exploda boolean
Grupurile cărora le aparțin aplicațiile EMBOSS au două forme, explodate și nu
a explodat. Numele grupurilor explodate sunt mai numeroase și adesea formulate vag decât
cele neexplodate. Numele explodate sunt formate din definițiile grupului
nume care încep ca NAME1:NAME2 și care sunt apoi extinse în mai multe combinații
dintre nume ca: „NUME1”, „NUME2”, „NUME1 NUME2”, „NUME2 NUME1”. Numele neextinse
sunt pur și simplu ca: „NUME1 NUME2”. Valoarea implicită: N

-showkeywords boolean
Valoarea implicită: N

Avansat secțiune
-sensibil boolean
În mod implicit, cuvintele cheie de interogare sunt corelate cu numele termenilor EDAM (și sinonimele)
numai. Această opțiune potrivește, de asemenea, cuvintele cheie cu definițiile termenilor EDAM și vor
prin urmare (de obicei) raportați mai multe potriviri. Valoarea implicită: N

-subclase boolean
Extindeți potrivirile de interogare pentru a include toți termenii care sunt specializări (EDAM
subclase) de tip potrivit. Valoarea implicită: Y

- învechit boolean
Comportamentul implicit este de a nu folosi sau returna termeni învechiți. Această opțiune, dacă este setată, va
include toți termenii. Valoarea implicită: N

-grava boolean
Dacă utilizați această opțiune, atunci documentația programului EMBOSS va fi căutată. Dacă aceasta
opțiunea este setată să fie falsă, atunci doar programele EMBASSY vor fi căutate (dacă
-opțiunea ambasadei este adevărată). Programele EMBASSY nu fac parte strict din EMBOSS, ci folosesc
aceleași biblioteci de cod și împărtășesc același aspect și simț, dar sunt în general dezvoltate
de către persoane care doresc ca programele să fie în afara schemei de licență publică generală GNU
Valoarea implicită: Y

-ambasadă boolean
Dacă utilizați această opțiune, atunci documentația programului EMBASSY va fi căutată. Dacă aceasta
opțiunea este setată să fie fals, atunci vor fi căutate numai programele EMBOSS (dacă
-opțiunea de relief este adevărată). Programele EMBASSY nu fac parte strict din EMBOSS, dar folosesc
aceleași biblioteci de cod și împărtășesc același aspect, dar sunt în general dezvoltate de
persoanele care doresc ca programele să fie în afara schemei de licență publică generală GNU
Valoarea implicită: Y

- showembassy şir
Dacă utilizați această opțiune, atunci această documentație a programului pachetului EMBASSY va fi
căutat. Programele EMBASSY nu fac parte strict din EMBOSS, dar folosesc același cod
biblioteci și împărtășesc același aspect și simț, dar sunt, în general, dezvoltate de oameni care
doresc ca programele să fie în afara schemei de licență publică generală GNU

-colon boolean
Grupurile cărora aplicațiile EMBOSS aparțin până la două niveluri, de exemplu
grupul primar „ALIGNMENT” are mai multe subgrupuri sau grupuri de al doilea nivel, de exemplu:
CONSENS, DIFERENȚE, PLOTELE PUNCT, GLOBAL, LOCAL, MULTIPLU. Pentru a ajuta programele care analizează
ieșirea wossname care necesită numele acestor subgrupuri, va fi două puncte „:”.
plasat între primul și al doilea nivel al numelui grupului dacă această opțiune este adevărată.
Notă: Acest lucru nu se aplică dacă numele grupurilor au fost explodate cu „exploda”
opțiune. Valoarea implicită: N

-gui boolean
Această opțiune este destinată să-i ajute pe cei care proiectează interfețe grafice pentru utilizator
aplicațiile emboss. Unele programe EMBOSS sunt nepotrivite pentru rularea într-o interfață grafică,
acestea includ alte programe de meniu și editori interactivi. Această opțiune vă permite
raportați doar acele programe care pot fi rulate dintr-o GUI Valoare implicită: N

producție secțiune
-outfile outfile
Valoare implicită: stdout

html secțiune
-html comutare
Dacă trimiteți rezultatul într-un fișier, acesta îl va formata pentru a fi afișat ca tabel
într-un document WWW. Valoarea implicită: N

-grupuri boolean
Dacă utilizați această opțiune, atunci numai numele grupurilor vor fi afișate în fișierul Implicit
valoare: N

-alfabetic boolean
Dacă utilizați această opțiune, atunci veți obține o singură listă cu numele programelor și
descrieri în loc ca programele să fie listate în grupurile lor funcționale. Mod implicit
valoare: N

Utilizați wossoupute online folosind serviciile onworks.net