Aceasta este aplicația Linux numită ADOMA a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca adoma-1.0.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită ADOMA cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CAPTURĂ DE ECRAN:
ADOMA
DESCRIERE:
ADOMA înseamnă: Alternative Display Of Multiple Alignment. ADOMA poate crea patru afișaje diferite ale unei alinieri secvențe multiple: o aliniere ClustalW în format HTML, o aliniere ClustalW simplificată în format HTML și/sau txt și o aliniere ClustalW colorată în format HTML. Pentru exemple ale acestor fișiere de ieșire, verificați capturile de ecran. ADOMA folosește ClustalW pentru a crea alinierea multiplă din secvențe de ADN sau proteine și le afișează ușor diferit de producția normală a ClustalW. ADOMA este un program de linie de comandă care poate fi utilizat cu ușurință în conducte.
Pentru mai multe informații consultați README.md în secțiunea Fișiere.
Cum să citez ADOMA:
Zaal, D. și Nota, B. (2016), ADOMA: A Command Line Tool to Modify ClustalW Multiple Alignment Output. Mol. Inf., 35: 42–44. doi: 10.1002/minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
Interfața cu utilizatorul
Linie de comanda
Limbaj de programare
Shell Unix, Python
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/adoma/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.